全寮制の「私立愛津女学園」には、体制維持を願う佐学派と、共学化を望む討学派の対立が生まれていた。男子校から代表として転入した悠は、双方から重要人物としてねらわれてしまう。学園には争いをまとめるために選抜された、新選組と呼ばれる優秀な女生徒たちがいた。いずれも剣の腕に優れ、共学化に反対する彼女たちは、悠を渡すまいと身柄を確保する。悠は鬼の副長と恐れられる土方歳緒と組まされ、強引に討学派との戦いに巻き込まれてしまい…。